为什么约束边缘的位置单多多少少会发生变形呢？

你约束的是节点，部分节点不动不代表单元没有变形。另外，一般处理约束的方式都是大数法，结果只能在某种意义下的残差最小，并不能保证完全符合你给定的约束值，但是一般也就只有非常小的差距~