直通 Wolfram 研发:Wolfram 化学概览
Wolfram语言中的化学简史
ChemicalData -> Entity -> Molecule
化学表达式
ChemicalFormula
ChemicalReaction
MoleculeName
FindIsomers
分子可视化
原子和键合标签
新的绘图功能
模式匹配
MoleculeMatchQ
MoleculeSubstructureCount, MoleculeContainsQ, MoleculeFreeQ
化学转换
FeaturespacePlot
Wolfram化学资源
ChemicalData
"Chemical" 实体
从第10版开始,实体为Wolfram知识库提供了一个统一的接口
扩展了查询多个实体或多个属性的语法
Molecule:一个可计算的化学对象
第12版引入了Molecule,一个可计算的对象,可以代表任何单一的分子:
一个分子是由原子和键组成的:
分子属性按需计算:
可以通过 MoleculeModify 轻松改变结构:
ChemicalFormula
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一个 "化学 "实体代表一个在知识库中具有记录的单一化学物类,其具有完整的属性,如熔点、比热容等;
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一个分子可以是任何化学结构,必须有指定的连通性;
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化学式(ChemicalFormula)只有一个原子类型及其系数的列表——它代表具有给定公式的任何(或所有)化学物类。
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化学式有明确的分子质量和电荷:
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一个分子可以与一个给定的公式相匹配
ChemicalReaction
获取反应物或产物:
获取产物的计数:
显示反应式:
根据方程式串创建化学反应:
这里的输入被解释为化学式:
根据 ReactionSMILES 字符串创建化学反应:
在这里,反应的组成部分是分子对象:
使用 IUPAC 名称创建分子。
使用绘图主题来控制是否显示氢或如何描述芳烃键。
MoleculePlot3D 有助于快速生成交互式绘图,其绘图主题对应于常见情形。
通过参考原子索引来突出原子或键。
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AtomLabels 和 BondLabels 是 MoleculePlot 和 MoleculePlot3D 的新选项。
范例:TNT 分子图,按其氧化状态标记所有的碳原子和氮原子
MoleculeMatchQ
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加入其他 Molecule 模式匹配函数:
FindMoleculeSubstructure
MoleculeContainsQ
MoleculeFreeQ
MoleculeSubstructureCount
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找到在氧和氮之间有一个芳香键的异构体,并将它们排列在最大的共同子结构上
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本范例使用了 FindIsomers、MoleculeContainsQ、MoleculeMaximumCommonSubstructure 和 MoleculeAlign
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现在在三维空间中排列所有分子
计算 2300 毫克钠所含的毫摩尔数:
12.3 版本为分子对象引入了新的内置特征提取器。
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化学工具
Wolfram 函数资源库——专业化学函数
Wolfram 数据资源库——可计算化学数据组
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计算器 减少认知负荷,促进实验设计中更深层次的化学思维。
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